विषय

• सॉफ्टवेयर अवलोकन
• समर्थित फ़ाइल प्रकार
• प्राथमिक फ़ाइल एक्सटेंशन
• एकीकृत जीनोम ब्राउज़र 9 द्वारा उपयोग की जाने वाली अन्य फ़ाइल एक्सटेंशन

संस्करण (6/29/2016 तक)	9
प्लेटफार्म
लाइसेंस	खुला स्त्रोत
वर्ग	वैज्ञानिक

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सॉफ्टवेयर अवलोकन

मुख्य विशेषताएं

• GenBank और FASTA जैसे विभिन्न जीनोम स्वरूपों का समर्थन करता है
• ज़ूमिंग और पैनिंग एनिमेशन के साथ डेटा के साथ सहभागिता करें
• क्विकअलाड साइटों से पहुंच और लोड जीनोम
• विभिन्न ग्राफ रूपों में डेटा ट्रांसफ़ॉर्म करें
• ड्रॉपबॉक्स के माध्यम से सहयोगियों के साथ डेटा साझा करें
• अतिरिक्त कार्यक्षमता के लिए प्लग इन स्थापित करें

एकीकृत जीनोम ब्राउज़र (आईजीबी) एक खुला स्रोत कार्यक्रम है जिसका उपयोग बड़े जीनोमिक डेटासेट को देखने और जानने के लिए किया जाता है। आप विभिन्न डेटा प्रारूप देख सकते हैं, अपने डेटा के साथ सहभागिता कर सकते हैं, ग्राफ़ बना सकते हैं, अपनी जानकारी को छवियों के रूप में सहेज सकते हैं, और आपको सहयोगियों के साथ डेटा साझा कर सकते हैं।

IGB आपको एनोटेशन और संरेखित अनुक्रम से डेटा देखने की अनुमति देता है। कार्यक्रम FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband और GenBank जैसे कई स्वरूपों का समर्थन करता है। आप डेटा ले सकते हैं और इसे कवरेज दिखाने के लिए डेटा अंतर और गहराई ग्राफ़ को हाइलाइट करने के लिए बेमेल ग्राफ़ सहित विभिन्न ग्राफ़ रूपों में बदल सकते हैं। आप अपने डेटा के साथ IGB की जूमिंग और पैनिंग एनिमेशन के माध्यम से भी बातचीत कर सकते हैं।

IGB आपको QuickLoad साइटों से जीनोम को एक्सेस और लोड करने में सक्षम बनाता है, जो विज़ुअलाइज़ेशन उद्देश्यों के लिए निर्देशिकाओं, अनुक्रमों और अन्य डेटा फ़ाइलों की सरल प्रणाली हैं। IGB स्क्रिप्ट के उपयोग के माध्यम से कार्यक्षमता और वर्कफ़्लो स्वचालन को जोड़ने के लिए प्लगइन समर्थन के साथ उन्नत कार्यक्षमता प्रदान करता है। IGB आपको अपने डेटा को साझा करने के लिए उन्नत सुविधाएँ भी देता है, चाहे वह अपने प्रोजेक्ट में अपने सहयोगियों को पहुँच देने के लिए इसे उच्च गुणवत्ता वाले JPEG, PNG, या SVG इमेज या ड्रॉपबॉक्स में डेटा संग्रहित कर रहा हो।

IGB मुख्य रूप से विश्वविद्यालय के शोधकर्ताओं, जीवविज्ञानी और जैव सूचना विज्ञानियों द्वारा उपयोग किया जाता है। यह विभिन्न प्रकार के जीनोम डेटा प्रारूप खोलने, विभिन्न ग्राफ़ के रूप में डेटा की कल्पना करने और सहयोगियों के साथ डेटा साझा करने के लिए उन्नत उपकरण प्रदान करता है। दुर्भाग्य से, कार्यक्रम निरंतर विकास के लिए अनुदान पर निर्भर करता है, जिसका अर्थ है कि आवेदन के लिए समर्थन किसी भी समय बंद हो सकता है। हालाँकि, एकीकृत जीनोम ब्राउज़र अभी भी उन जीनोम डेटा का पता लगाने और उनका विश्लेषण करने के लिए एक सक्षम, अनुकूलन कार्यक्रम है।

समर्थित फ़ाइल प्रकार

प्राथमिक फ़ाइल एक्सटेंशन

.XML - एक्सएमएल फ़ाइल

एकीकृत जीनोम ब्राउज़र 9 द्वारा उपयोग की जाने वाली अन्य फ़ाइल एक्सटेंशन

समर्थित फ़ाइल प्रकार
।बिस्तर	UCSC BED एनोटेशन ट्रैक फ़ाइल
.DAS	DeltaMaster विश्लेषण सत्र
.FA	FASTA फॉर्मेट सीक्वेंस फाइल
.FAS	FASTA अनुक्रम फ़ाइल
.FASTA	FASTA अनुक्रम फ़ाइल
.GB	जेनबैंक डेटा फ़ाइल
.SGR	SGR जीनोम डेटा फ़ाइल
.USEQ	USeq जीनोम डेटा फ़ाइल